Existen causales de excepción a la prohibición de extracción y poda. Previo análisis de cada caso en particular, un árbol podrá ser extraído o podado cuando:

• exhiba un estado de decrepitud o de conformación peligrosa;
• cause daños o importe riesgo a personas o bienes;
• pertenezcan a especies no aptas o inapropiadas por características o envergadura para determinada zona o ubicación; 
• impidan u obstaculicen el trazado y realización de obras públicas o la prestación de servicios públicos; 
• ameriten consideración especial, según lo entienda la Autoridad de Aplicación.